和多數(shù)實驗室一樣，PCR實驗室也會不斷產(chǎn)生廢水，其污染類型多、成分復雜，處理起來也給實驗室管理工作帶來了一定的挑戰(zhàn)。這些廢水對人體和環(huán)境都有一定的危害，其中一些難以降解，可以存在于環(huán)境中，一些在降解過程中產(chǎn)生二次污染，更嚴重通過食物鏈富集到人體中引起毒性，因此，醫(yī)學檢驗PCR實驗室廢水處理尤為重要。

      實驗室廢水主要來自醫(yī)療儀器檢測、門診處理、病理檢驗、疾控中心產(chǎn)生的含有大量的病原細菌、病菌和化學試劑等。其中，醫(yī)學檢驗科PCR實驗室廢水污染主要包括：
1.擴增產(chǎn)物、天然基因組DNA；
2.重金屬，如銅、鉛、錳、六價鉻等；
3.致病病原體，如蟲卵、細菌、病毒等；
4.試劑、放射性同位素；
5.各類器皿洗滌廢水。