根據(jù)廢水中所含主要污染物性質(zhì), 可以分為實驗室有機和無機廢水兩大類。無機廢水主要含有重金屬、重金屬絡(luò)合物、酸堿、硫化物、鹵素離子以及其他無機離子等。有機廢水含有常用的有機溶劑、有機酸、醚類、、有機磷化合物、酚類、石油類、油脂類物質(zhì)。相比而言, 有機廢水比無機廢水污染的范圍更廣, 帶來的危害更嚴(yán)重。不同的廢水, 污染物組成不同, 處理方法和程度也不相同。實驗室污水的處理本著分類收集, 就地、及時地原位處理, 簡易操作, 以廢治廢和降低成本的原則。

 和多數(shù)實驗室一樣，PCR實驗室也會不斷產(chǎn)生廢水，其污染類型多、成分復(fù)雜，處理起來也給實驗室管理工作帶來了一定的挑戰(zhàn)。這些廢水對人體和環(huán)境都有一定的危害，其中一些難以降解，可以存在于環(huán)境中，一些在降解過程中產(chǎn)生二次污染，更嚴(yán)重通過食物鏈富集到人體中引起毒性，因此，醫(yī)學(xué)檢驗PCR實驗室廢水處理尤為重要。

      實驗室廢水主要來自醫(yī)療儀器檢測、門診處理、病理檢驗、疾控中心產(chǎn)生的含有大量的病原細菌、病菌和化學(xué)試劑等。其中，醫(yī)學(xué)檢驗科PCR實驗室廢水污染主要包括：
1.擴增產(chǎn)物、天然基因組DNA；
2.重金屬，如銅、鉛、錳、六價鉻等；
3.致病病原體，如蟲卵、細菌、病毒等；
4.試劑、放射性同位素；
5.各類器皿洗滌廢水。